تعیین هویت مولکولی و شجره شناسی بر اساس ژن نوکلئوکپسید ویروس برونشیت عفونی پرندگان جدا شده از گله های گوشتی در سالهای 1393-1394

زمینه مطالعه: برونشیت عفونی یک بیماری مهم از نظر اقتصادی در ماکیان بوده که به دلیل ظهور ژنوتیپ‌های جدید ویروس برونشیت عفونی، کنترل این بیماری بعنوان یک مشکل جدی در صنعت طیور در دنیا مطرح است و پیش از این، مطالعه جامعی برروری این ژن بر روی ژنوتیپ‌های سال‌های اخیر مختلف کشور انجام نگردیده بود. هدف: لزوم از انجام این مطالعه تعیین هویت مولکولی و شجره شناسی بر اساس ژن نوکلئوکپسید ویروس برونشیت عفونی جدا شده از گله‌های گوشتی ایران در سال‌های 1393-1394 می‌باشد. روش کار : در این بررسی ژن نوکلئو کپسید ده جدایه از چهار نوع ژنوتیپ متفاوت ویروس برونشیت عفونی با استفاده از پرایمر‌های اختصاصی تکثیر و با نرم افزار‌های مناسب شجره شناسی و تعیین ساختار مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج : از نظر شجره شناسی ویروس‌های برونشیت عفونی گروه ماساچوست، QX و 793/B در گروه خود قرار گرفتند و ژنوتیپ ویروس واریانت 2 در کنار سایر ویروس‌های جدا شده از ایران قرار داشتند. در صد تشابه بر اساس اسید آمینه، بین سویه‌های مختلف مورد مطالعه بین 97/89 تا 75/99٪ تشابه وجود داشت. بیشترین تشابه بین دو ژنوتیپ IBKG-1و IBKG-8 مورد مطالعه در گروه 793/B و کمترین تشابه بین دو ژنوتیپ QX و واریانت 2 (ویروس‌های IBKG-5 و IBKG-9) بوده، که این میزان تفاوت برای ژن نوکلئوکپسید (محافظت شده) نسبتاًً بالا می‌باشد. بررسی بیوانفورماتیک نشان داد که پروتئین در این ویروس‌ها بین ۶ تا ۷ صفحه بتا و بین ۸ تا ۱۰ مارپیچ آلفا دارند. نتیجه‌گیری‌نهایی: نتایج حاصل از این مطالعه می‌تواند اطلاعات مناسبی در زمینه استفاده از اطلاعات این پروتیئن در تولید پروتئین‌های نو ترکیب جهت تولید کیت‌های الایزا و روش‌های تشخیص سریع، واکسن‌های نو ترکیب و همچنین اپیدمیولوژی مولکولی این بیماری ویروسی مهم در کشور نماید.